MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015564	TGCT	2	8	936094	936101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_015564	AGT	2	6	936106	936111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015564	T	6	6	936123	936128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015564	GGGTGT	2	12	936129	936140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015564	CGG	2	6	936146	936151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015564	CCGG	2	8	936163	936170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015564	GT	3	6	936179	936184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015564	ACGA	2	8	937699	937706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_015564	CAC	2	6	937714	937719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_015564	AC	3	6	937735	937740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_015564	TGGTG	2	10	941667	941676	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015564	ACTG	2	8	943216	943223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_015564	TCT	2	6	943271	943276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015564	ATT	2	6	949388	949393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015564	AGA	2	6	949396	949401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015564	GGA	2	6	949544	949549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015564	GCG	2	6	949578	949583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_015564	GTT	2	6	954058	954063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015564	ATC	2	6	954153	954158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015564	TGG	2	6	954198	954203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015564	GAG	2	6	958405	958410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015564	CG	3	6	958439	958444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_015564	TCCT	2	8	959333	959340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_015564	GC	3	6	966322	966327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_015564	TAG	2	6	972135	972140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015564	CA	3	6	974704	974709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_015564	ACC	2	6	974716	974721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_015564	GCT	2	6	975994	975999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015564	G	6	6	977174	977179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015564	TG	4	8	977189	977196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015564	GCGGTG	2	12	977199	977210	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1532	NC_015564	GC	3	6	980266	980271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_015564	GAG	2	6	980357	980362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015564	TGA	2	6	980366	980371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015564	CAC	2	6	980378	980383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_015564	CTTG	2	8	985431	985438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_015564	GCG	2	6	988423	988428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_015564	GGGT	2	8	988838	988845	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015564	CCAC	2	8	988915	988922	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1540	NC_015564	TGCGA	2	10	988924	988933	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_015564	GTGCTG	2	12	988980	988991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1542	NC_015564	CGT	2	6	989292	989297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_015564	CCT	2	6	990511	990516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_015564	TGG	2	6	990517	990522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015564	TAG	2	6	990603	990608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015564	AGG	2	6	990637	990642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015564	ACC	2	6	991884	991889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_015564	CAG	2	6	991901	991906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_015564	G	6	6	991935	991940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015564	GAAT	2	8	993172	993179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015564	CCGC	2	8	996691	996698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1552	NC_015564	GGT	2	6	996704	996709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015564	CCG	2	6	996715	996720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015564	TCC	2	6	1004326	1004331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_015564	ACA	2	6	1004349	1004354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_015564	CTG	2	6	1004376	1004381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015564	CTG	2	6	1004393	1004398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_015564	GTTT	2	8	1005350	1005357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015564	TTG	2	6	1005371	1005376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015564	CAA	2	6	1005386	1005391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015564	ATC	2	6	1007210	1007215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_015564	GCC	2	6	1007306	1007311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_015564	CCG	2	6	1010015	1010020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_015564	TGC	2	6	1010034	1010039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_015564	ACC	2	6	1011400	1011405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_015564	GCGT	2	8	1016288	1016295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_015564	CGG	2	6	1016383	1016388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015564	AGGC	2	8	1016413	1016420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_015564	CCT	2	6	1019501	1019506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_015564	CCA	2	6	1024172	1024177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_015564	AT	3	6	1032340	1032345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015564	GTT	2	6	1032350	1032355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015564	CGA	2	6	1033490	1033495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_015564	TG	3	6	1033584	1033589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015564	GGC	2	6	1033590	1033595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_015564	CA	3	6	1033615	1033620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_015564	CG	4	8	1033624	1033631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_015564	CG	3	6	1036957	1036962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_015564	CT	3	6	1036980	1036985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_015564	GGC	2	6	1037005	1037010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_015564	AT	3	6	1037080	1037085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015564	CCG	2	6	1037151	1037156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_015564	TG	3	6	1037168	1037173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015564	CTC	2	6	1039748	1039753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_015564	GCG	2	6	1039809	1039814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015564	ATG	2	6	1040680	1040685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015564	AC	3	6	1040695	1040700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_015564	CAA	2	6	1040751	1040756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_015564	TTCG	2	8	1040772	1040779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_015564	CG	3	6	1040778	1040783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_015564	ATC	3	9	1040833	1040841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_015564	GTT	2	6	1043989	1043994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015564	CCG	2	6	1044005	1044010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015564	CT	3	6	1047921	1047926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_015564	TG	3	6	1047978	1047983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015564	GGTT	2	8	1051320	1051327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015564	CAG	2	6	1053367	1053372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_015564	TCC	2	6	1053626	1053631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_015564	CTA	2	6	1054465	1054470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_015564	TAG	2	6	1054474	1054479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015564	CTA	2	6	1054488	1054493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_015564	CG	3	6	1054509	1054514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_015564	GAT	2	6	1054515	1054520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015564	CG	3	6	1054523	1054528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_015564	ATTG	2	8	1057885	1057892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015564	CGAT	2	8	1057900	1057907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_015564	CGA	2	6	1057998	1058003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_015564	ACT	2	6	1058163	1058168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015564	CCA	2	6	1058169	1058174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_015564	CCA	2	6	1058177	1058182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_015564	ACA	2	6	1058323	1058328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015564	ATC	2	6	1058334	1058339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_015564	GTG	2	6	1058340	1058345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015564	TCC	2	6	1058366	1058371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_015564	CGT	2	6	1058440	1058445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_015564	GT	3	6	1058525	1058530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015564	GTTG	2	8	1058554	1058561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015564	ACG	2	6	1058566	1058571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015564	CCG	2	6	1058579	1058584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_015564	TCA	2	6	1058602	1058607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015564	CCA	2	6	1059118	1059123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_015564	TTGTG	2	10	1059708	1059717	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015564	TAG	2	6	1059753	1059758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015564	CATG	2	8	1063402	1063409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_015564	CAT	2	6	1063784	1063789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015564	CCTC	2	8	1063790	1063797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1627	NC_015564	ATC	2	6	1063860	1063865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_015564	GGC	2	6	1063868	1063873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_015564	AG	3	6	1064082	1064087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015564	TAG	2	6	1067226	1067231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015564	CG	3	6	1067239	1067244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_015564	CG	3	6	1068207	1068212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_015564	GCT	2	6	1068347	1068352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_015564	TGC	2	6	1068385	1068390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_015564	GCTG	2	8	1070377	1070384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_015564	AGAACG	2	12	1070392	1070403	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1641	NC_015564	A	6	6	1073897	1073902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1646	NC_015564	CG	3	6	1076047	1076052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1647	NC_015564	GGT	2	6	1076075	1076080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1649	NC_015564	ACC	2	6	1079433	1079438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1650	NC_015564	GCTGAG	2	12	1079442	1079453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1654	NC_015564	GGGA	2	8	1083284	1083291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1655	NC_015564	TCC	2	6	1083737	1083742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1656	NC_015564	TCAG	2	8	1083753	1083760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1664	NC_015564	GCT	3	9	1086468	1086476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1675	NC_015564	CGCGT	2	10	1088132	1088141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1730	NC_015564	TCG	2	6	1122790	1122795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1753	NC_015564	GCG	2	6	1126190	1126195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1754	NC_015564	ACA	2	6	1126318	1126323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1755	NC_015564	CCGCC	2	10	1128152	1128161	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1756	NC_015564	TC	3	6	1130853	1130858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1757	NC_015564	CCGT	2	8	1130860	1130867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1758	NC_015564	TA	3	6	1130901	1130906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1759	NC_015564	CAC	2	6	1130922	1130927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1760	NC_015564	GATC	2	8	1130981	1130988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1761	NC_015564	GGAA	2	8	1130994	1131001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1762	NC_015564	TCG	2	6	1136116	1136121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1763	NC_015564	GT	3	6	1137232	1137237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1769	NC_015564	AGTC	2	8	1139286	1139293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1773	NC_015564	CTGC	2	8	1141951	1141958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1873	NC_015564	TGT	2	6	1220877	1220882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1875	NC_015564	AAGC	2	8	1222494	1222501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1879	NC_015564	T	7	7	1222625	1222631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1880	NC_015564	TCGT	2	8	1222641	1222648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1881	NC_015564	ACT	2	6	1222734	1222739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1883	NC_015564	TG	3	6	1226434	1226439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1884	NC_015564	CG	3	6	1226446	1226451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1885	NC_015564	TGG	2	6	1226466	1226471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1886	NC_015564	GC	3	6	1226727	1226732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1887	NC_015564	TCATCG	2	12	1226742	1226753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1888	NC_015564	CT	4	8	1226760	1226767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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